1976年成立同位素科（核医学科、核医学教研室），开展甲状腺功能亢进和甲状腺癌的放射性碘核素治疗(131I)、骨转移肿瘤的核素治疗（89Sr）以及肿瘤125I粒子植入的工作，同时承担重庆医科大学的核医学教学工作，核医学科是重庆市开展核素治疗较早的核医学科之一，核素治疗有43年的历史，积累了丰富的临床经验。开展多种器官及肿瘤的核素显像诊断。拥有开展核医学工作的雄厚基础。江南院区核医学科有高标准的核素病房7间，14张床位；目前核医学开开展核素治疗甲亢200余例/年、甲癌600余例/年，放射性粒子植入600余例/年，年门诊1000余例/年。
亚专业组技术有：131I治疗甲亢及甲状腺癌放射性125I粒子植入，89Sr治疗转移性骨肿瘤，90Sr治疗瘢痕及血管瘤等。
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