科研成果丰硕，连续承担国家“六五”至“十三五”期间关于病毒性肝炎和其他传染性疾病及寄生虫病的重点攻关项目。近5年，承担传染病及相关领域国家重大科技专项7项，其他国家级科研项目48项，其中国家自然科学基金优秀青年科学家基金项目1项，重庆市科研项目近百项。近5年来团队成员在传染病相关领域国际主流期刊Nature Medicine、Gut、Hepatology、Journal of Hepatology、Journal of Infectious Diseases、Antiviral Research、J Clin Microbiol等发表高水平论文，影响因子大于5分SCI论文107篇，其中大于10分SCI论文10篇，最高影响因子36.13。申请专利15项。“HIV暴露前生物预防策略研究”等三项研究获得重庆市科学技术科技进步二等奖。《核苷(酸)类似物治疗部分应答的乙型肝炎患者通过聚乙二醇干扰素α-2a治疗获得HBsAg消失:New Switch研究》获第四届中国科协优秀论文遴选计划优秀论文证书。2020年新冠疫情爆发以来，团队成员率先研发了7个新冠抗体检测试剂和新冠病毒IgM/IgG抗体检测试剂盒，并在国际顶尖医学杂志《Nature Medicine》在线发表了题目为《Antibody responses to SARS-CoV-2 in COVID-19 patients》，《Clinical and immunological assessment of asymptomatic SARS-CoV-2 infections》，《Seroprevalence of immunoglobulin M and G antibodies against SARS-CoV-2 in China》的论文，为国家长期新冠防控策略制定和疫苗的免疫策略提供了理论支撑。
承办的《中华肝脏病杂志》已成为全国百强期刊，创办的《Journal of clinical and translational Hepatology》现已录入PubMed数据库，主办的“全国肝脏疾病临床学术大会”和“慢性病毒性肝炎抗病毒治疗难点和热点学术会议”更是成为我国传染病学和肝病学领域公认的品牌会议。这些平台吸引了全国大量的科技工作者和临床医生参与，为我国传染病学人才的培养做出了卓越的贡献。
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